北京基因组所合作揭示白血病耐药的基因组演化历程和治疗策略

近日，中国科学院北京基因组研究所刘欣研究组联合中国医学科学院血液病医院竺晓凡团队以及美国St. Jude儿童研究医院杨俊团队，首次运用多种组学测序技术和功能实验相结合的方式系统揭示了酪氨酸激酶抑制剂（TKI）临床治疗急性淋巴细胞白血病耐药的机制，并提出新的治疗策略。相关成果发表在血液学权威期刊Blood上。

TKI是人类历史上第一个成功的靶向治疗药物，成功将慢性粒细胞性白血病患者的长期预后生存率提高到了90%以上，其以卓越的疗效成为靶向药物治疗恶性肿瘤的典范。然而，一直以来，该抑制剂的耐药性也是困扰部分临床病人的重大难题。近年来，临床上发现该药物也可用于治疗急性淋巴细胞白血病（ALL），那耐药性是否依然存在呢？耐药机制又是什么呢？

研究团队首次发现使用TKI治疗缓解后又复发的儿童ALL病人，并对其初诊、化疗耐药、TKI耐药复发三个时间点的样本进行全基因组和转录组的测序。分析发现，该病人携带一种新的致病融合基因AGGF1-PDGFRB，其致病性在BaF3/Arf-/-细胞系中得到验证。另外，研究团队还刻画了该病人疾病进程中的克隆结构和克隆演化，发现PDGFRB点突变在TKI治疗过程中特异出现，并使白血病细胞获得生长优势，成长为TKI耐药复发时的主克隆；体外细胞系功能实验也证实了PDGFRB突变可直接导致TKI耐药这一论断。此外，由于PDGFRB主要下游通路为JAK-STAT通路，研究人员使用广谱JAK抑制剂CHZ868进一步处理携带PDGFRB突变的白血病细胞，发现其对该抑制剂高度敏感，提示CHZ868可能是一种治疗该类耐药病人的潜在治疗手段。

该研究揭示了靶向药物的耐药与治疗过程中的基因组演化有关，融合基因或点突变的出现都可能影响药物的治疗效果；针对不同的基因组异常，可给予针对性的治疗措施以逆转耐药。这些发现有助于推动科研人员及临床医生进一步了解靶向药物，为更好地推动精准治疗、造福病人打下基础。

该项研究得到中科院百人计划、国家自然科学基金委的资助。

PDGFRB点突变直接导致酪氨酸激酶抑制剂（TKI）耐药，小分子抑制剂CHZ868是潜在的治疗新策略