华夏时讯

绘测人类癌症染色质形貌

通过对人类原发性癌症的基本未知的染色质形貌进行绘测,研究人员对不同癌症相关基因的调控有了新的了解。这项研究为寻求了解跨越一系列癌症类型调控动态的科研人员提供了宝贵的资源。

尽管可公开得到的《癌症基因组图谱》(TCGA)数据记录收集了丰富的有关人类癌症的基因组信息,但一种更加系统的对DNA—蛋白复合物的调查(见于被称作染色质的复合物质中)或能以影响癌症预后和治疗的方式帮助更好地在影响不同癌症相关基因的开关中插入楔子。

一个近来在研究可及性染色质中所取得的进展被称作ATAC-seq,它能在少量样本中进行染色质的综合分析。ATAC-seq用一种酶来揭示染色质的可及片段,这转而能披露DNA的活性调控成分。M. Ryan Corces和同事用ATAC-seq来绘测23种人类原发性癌症的染色质可及性形貌,所用的是由TCGA衍生的410个样本。通过识别超过50万个可及DNA成分,Corces等大幅扩展了癌症基因组已知DNA调控成分的范畴。他们的研究为癌症的遗传风险基因座提供了新的线索。研究结果还提示,需要有一种系统性了解癌症非编码基因组学的方法以真正地推进对癌症疾病的有效诊断和治疗。

 
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